Professional background

I am a researcher in computational marine ecology since 2009 and associate professor at the Biology Department of Université Laval since 2013. 

I’m focusing my research efforts to better understand and predict the structure and functioning of organisms and ecosystems (essentially marine) through numerical methods. 

I worked as a postdoctoral fellow at the University of Maine and Gulf of Maine Research Institute (GMRI)with professors Andrew J. Pershing and Jeffrey A. Runge from 2009 to 2011. I worked on the modelling of the population dynamics of zooplankton facing changing environments in northern seas. 

Next I joined Fisheries and Oceans Canada where I developed coupled bio-physical models of microzooplankton (krill and jellies) in the Gulf of St. Lawrence and the Canadian Atlantic area, until I got appointed as professor in computational Arctic marine ecology at Université Laval at the beginning of 2013. 

- Français - 

Je suis chercheur en écologie marine computationnelle depuis 2009 et professeur au Département de Biologie de l’Université Laval depuis 2013. Je concentre mes efforts de recherche à mieux comprendre et prédire la structure et le fonctionnement des organismes et des écosystèmes (essentiellement marins) grâce aux méthodes numériques. 

J’ai travaillé comme postdoctorant à la University of Maine et au Gulf of Maine Research Institute (GMRI) avec les professeurs Andrew J. Pershing et Jeffrey A. Runge de 2009 à 2011 sur la modélisation de la dynamique des populations de zooplancton face aux changements environnementaux dans les océans tempérés en boréaux. 

J’ai rejoint par la suite Pêches et Océans Canada où j’ai travaillé à la modélisation bio-physique couplée du macrozooaplancton (krill et méduses) dans le Golfe du Saint-Laurent et l’Atlantique canadien, jusqu’à l’obtention de mon poste de professeur en écologie marine arctique à l’Université Laval au début de 2013.

Academic background

Post-doctorat, University of Maine, 2009-2011 « Understanding copepod life-history and diversity using a next-generation zooplankton model » Doctorat en océanographie, Université du Québec à Rimouski, 2009« Étude de la dynamique des populations de Calanus finmarchicus dans l’estuaire et le golfe du Saint-Laurent (Canada.) » Maîtrise en océanographie, Université du Québec à Rimouski, 2003 « Étude de la fécondité du copépode calanoïde Temora longicornis dans le sud-ouest du golfe du Saint-Laurent ».

Research interests

At the heart of my research lies the study of interactions between marine organisms with oceanic circulation and other physical properties of this unique environment. I have, for example, focused my research efforts to better characterize the spatio-temporal distribution of copepods (zooplankton) fed upon by the endangered North-Atlantic Right Whales that have recently, and with a hefty price, moved their summer feeding grounds from the Gulf of Maine to the Gulf of St. Lawrence. My laboratory has also developed since my beginning as a professor at Université Laval the study of individual physiology and behaviour, trophic networks and other complex networks, machine learning algorithms and imagery technics of marine organisms. All with the ultimate goal of improving our ability to understand and predict the changes of structure and functioning of changing marine ecosystems, as well as the services they provide to human communities that rely on them. Numerical modelling of marine ecosystems Machine learning approaches Arctic marine ecosystems Bio-physical interactions in the Ocean Phyto, Zoo and Ichthyoplankton Ecological forecasts Participative science - Français - L’étude des interactions entre la biologie et le comportement des organismes marins et la circulation océanique et les propriétés physiques du milieu est au cœur de ma thématique de recherche. J’ai par exemple renouvelé mes efforts de recherche pour mieux comprendre la distribution spatiale et les variations temporelles de biomasse des copépodes dont se nourrissent les baleines noires de l’Atlantique, très menacées, et qui semblent avoir récemment délaissé le golfe du Maine pour aller s’alimenter dans le golfe du Saint-Laurent ! Mon laboratoire a également développé depuis mon entrée en fonction à l’Université Laval l’étude de la physiologie et du comportement au niveau individuel, l’étude des réseaux trophiques et des réseaux complexes, les algorithmes d’apprentissage machine et d’imagerie des organismes marins, toujours dans le but de développer notre capacité à comprendre et prédire les changements de structure et de fonctionnement des écosystèmes marins en plein bouleversement ainsi que des services rendus aux communautés humaines qui en dépendent. Modélisation numérique des écosystèmes marins Apprentissage machine / Intelligence artificielle Interactions bio-physiques dans l'Océan Phytoplancton, Zooplancton, Ichthyoplancton Prédictions écologiques Science participative

Ongoing research projects

  • Artificial intelligence application to the identification of functional traits of zooplankton from high-resolution images (ARTIFACTZ) Dynamics and functions of pelagic copepod communities in a changing Arctic Ocean Bridging Global change, Inuit Health and the Transforming Arctic Ocean (BriGHT) Network analysis of umbrella and indicator species: assessing the integrity of northern ecosystems BaySys: Contributions of climate change and hydro-electric regulation to the variability and change of freshwater-marine coupling in the Hudson Bay System Arc3Bio - Marine biodiversity, biological productivity and biogeochemistry in the changing Canadian Arctic – TERMINÉ 
  • Projet d’Aide à l’innovation Pédagogique : Révisions audiovisuelles sur R (ROAR) – TERMINÉ 
  • Production and consumption of krill in the Gulf of St. Lawrence: toward an ecosystem-based stock assessment – TERMINÉ 
  • Coupling biological and physical numerical models to explore the response of plankton to the ongoing transformation of the Arctic Ocean - TERMINÉ

Publications

Research